Tengo un  MacMini que utilizo como media center y lo manejo con el Apple Remote. A veces cuando utilizo el Macbook me resulta muy incómodo utiliar el mando con el media center ya que éste también activa, por ejemplo, el Front Row en mi Macbook.

Para desactivar el receptor de infrarrojos en mi Macbook hay que acceder a Preferences --> Security y activar la casilla "Disable remote control infrared receiver".

Desasctivar Infrarrojo